Опытные пользователи давно могли заметить, что в корневых каталогах накопителей обычно присутствует директория «System Volume Information». Если включены соответствующие службы, то эта директория служит для хранения данных точек восстановления, индексирования, теневых копий тома. Но даже если эти службы отключить, то директория всё равно будет создаваться. Даже на системном разделе я готов поставить целесообразность её наличия под вопрос — особенно, если используются сторонние решения для резервного копирования. Ну а на флеш-картах (или иных съемных накопителях) этой директории вообще не место, благо отключить её создание можно через реестр:
HKLM\SOFTWARE\Policies\Microsoft\Windows\Windows Search
Имя: DisableRemovableDriveIndexing
Тип: REG_DWORD
Значение: 1
Единственный нюанс — как нетрудно догадаться, при подключении накопителя к другому ПК директория «System Volume Information» будет создаваться вновь, т.е. понадобится провести подобную операцию на каждом компьютере. Более-менее разумный компромисс — это замещение на флешке директории «System Volume Information» файлом с тем же именем.